Хотя бинарные модули скорее всего не запустятся без заголовка SCE.
Либо в EBOOT прописан жёстко прямой путь к этим модулям на BD-привод или просто на GameID типа BLES12345, тогда эти файлы нужно кидать в папку патча BLES12345, т.е. копировать вместе с EBOOT.BIN.