[.//Hack]

Добавлю по этому поводу, вообще на винте в открытом виде должен быть только один файл cygwin1.dll, если у вас есть другие программы тоже использующие cygwin, то их нужно удалить (архивировать), в общем сделать все что угодно, чтобы этот файл не лежал в открытую. Просто очень часто глюки в программах именно из-за этого, когда на винте лежит более одной копии cygwin
Он может быть даже и не в папке Windows, он себя прописывает в реестр, как и большенство библиотек, поэтому лежать может где угодно
У меня была как-то подобная проблема проблема, дак этот cygwin в такой глуши нашел на своем винте, и после того как удалил, все стало работать